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Precellys Evolution可靠無偏的微生物RNA研磨提取
來源: Admin    更新時間: 2019-10-24    瀏覽: 134 人次



人們越來越擔心,科學界正在經歷一場可重復性危機。微生物組學是目前面臨最大挑戰的領域之一,因為在其工作流程的每一步都會引入大量的偏差[1]。這令研究人員開始使用模擬微生物菌落標準(如Zymobiomics®微生物菌落標準(Zymo Research Corp.,Irvine,CA))來質疑和驗證他們的方法。Zymobiomics®標準包含10種特性良好的微生物(即5種革蘭氏陽性、3種革蘭氏陰性和2種酵母),它們以規定的比例混合。該標準由不同大小和細胞壁韌性的微生物組成,是評估微生物工作流程每一步的理想標準。


研究顯示,在核酸提取步驟中選擇的細胞裂解技術可顯著影響微生物組二代測序(NGS)的分析結果[2]。珠式機械裂解已成為金標準。由于其強大的3D運動,Precellys Evolution在幾秒鐘內提供了強大的裂解功能。在這里,我們使用ZymoBIOMICS®微生物菌落標準來證明Precellys®Evolution生物樣品研磨器與Zymobiomics®DNA/RNA Miniprep試劑盒相結合能夠在不損害RNA完整性的情況下實現完全溶解,從而實現精確的亞基因組和微生物組分析。此外,我們還評估了用此工作流程從本標準中提取的核酸的質量,以及另外3個樣本,包括革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌以及人類糞便樣本。


Precellys生物樣品研磨器:

超快速: up to 10 000 rpm

超靈活: 0.5, 2, 7和 15mL研磨管

超高效: 強力3D振動

超保護: Cryolys Evolution新型冷卻技術,無需液氮和壓縮空氣


參考資料

1、Wesolowska-Andersen A, Bahl Ml, Carvalho V et al. Choice of bacterial DNA extraction method from fecal material influences community structure as evaluated by metagenomic analysis. Microbiome 2(1), 19 (2014)

2、Costea Pl. Zeller G, Sunagawa S et al. Towards standards for human fecal sample processing in metagenomic studies. Nat. Biotechnol. 35(11), 1069-1076 (2017)

3、Zymo Research is a privately-held American manufacturer of molecular biology research tools used for DNA and RNA research and analysis. Their offices are headquartered at 17062 Murphy Ave., Irvine, CA92614, Tel:949-679-1190


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